As Coordenações de Curso do IFMT Campus Rondonópolis desempenham um papel essencial na organização e no acompanhamento das atividades acadêmicas de cada área de formação. São responsáveis por articular docentes, discentes e setores institucionais, garantindo o bom andamento dos cursos e a qualidade do ensino ofertado.

Entre as coordenações estão os cursos técnicos e superiores em diversas áreas do conhecimento, como Alimentos, Administração (PROEJA), Informática, Química, Secretariado, Licenciatura em Ciências da Natureza, Análise e Desenvolvimento de Sistemas e Técnico em Química Subsequente ao Nível Médio.

Cada coordenação atua de forma integrada, promovendo o planejamento pedagógico, o apoio aos estudantes, a gestão das disciplinas e o fortalecimento da relação entre ensino, pesquisa e extensão — pilares fundamentais da formação técnica e tecnológica oferecida pelo IFMT Rondonópolis.