A comunidade acadêmica (servidores e estudantes) vota em chapas ou candidatos. O voto é paritário, com peso igual entre docentes, técnicos-administrativos e estudantes (normalmente 1/3 para cada segmento).

Data da última eleição para Reitor e Diretores-Gerais do IFMT: 25 de outubro de 2024 (pleito único, votação online).

Reitor(a) – a cada 4 anos – 4 anos, com possibilidade de uma recondução.

Diretor(a) – Geral de campus – a cada 4 anos – 4 anos, com possibilidade de uma recondução.